Покровская церковь в документах первый раз упоминается в 1722 г. в «прошении Святейшему Синоду повытчика Юрьевской провинции Григория Меньшикова о дозволении перенести из г Юрьева упразднившуюся Покровскую церковь с колокольней, утварью и находящимися при ней кельями за город к церкви Святых апостолов Петра и Павла, построенной на месте бывшего Петропавловского монастыря, и о переделке её, по перенесении, в теплую» Далее Меньшиков пишет, что Петропавловский монастырь существовал до литовского разорения, а в литовское разорение г. Юрьев и означенный монастырь в нём были разорены, после разорения, на месте монастыря, за городом построена была деревянная церковь Святых апостолов Петра и Павла. Она была холодной и служба в ней совершалась только в храмовый праздник и в следующую за ним неделю. Для этого присылались из городского Архангельского монастыря «черные священники», которые привозили с собой всю необходимую утварь.
Деревянная Покровская церковь в г. Юрьеве-Польском была построена в 1712 г. монахом Архангельского монастыря Кириллом, «колоколами и всякою церковною утварью удовольствована». Кирилл «присовокупил» к церкви «девич монастырь и малое число келий возградил, в которых жили монахини… и потом перешли … в Введенский монастырь» Кельи запустели, самой Покровской церкви стало «быть на том месте не у чего», потому что «прихоцкими в Юрьеве прежними церквами не умаление». Ходатайство Меньшикова не было уважено. В 1760 г. значится «за городом в посаде церкви приходские… церковь деревянная Покрова Богородицы». Деревянная церковь стояла до 1769 г., когда была построена, усердием прихожан каменная ныне существующая Покровская церковь.
В ней три престола, кроме главного-Покрова Пресвятой Богородицы, теплые приделы- Святителя Николая и Святого Пророка Илии.
С 1874 г. к Покровскому храму г. Юрьева-Польского был переведен священник Яков Силыч Апьбицкий (1810-1884). Его супругой была Евдокия Васильевна Миловидова. Дочь о Якова Силыча Альбицкого. Евгения Яковлевна, была супругой старшего священника в Феодоровском монастыре г. Переславля Залесского (с 1864 г.), духовного писателя Александра Ивановича Свирелина (1830-1906). Яков Апьбицкий в 1830 г. окончил Владимирскую семинарию, был лектором греческого, заием и древне-еврейского языков, с 1832 г. определен учителем Владимирского Духовного училища С 1833 года священник женского монастыря в Юрьеве. В конце XIX в. настоятелем храма был священник Аркадий Иванович Сергиевский. Причт церковный состоял из священника, диакона и псаломщика.
Владимирские епархиальные ведомости в 1892 г писали в корреспонденции из Юрьева: «В городе Юрьеве, в церкви По-крова Пресвятой Богородицы — церкви довольно бедной недавно организовался ещё небывалый здесь любительский хор, состоящий под руководством ветеринарного врача Н.И. Любимова из следующих лиц: городской врач С.С. Есипов, провизор аптеки С.В Семенов, учитель Н.В. Семенов, учительница, дочь местного исправника В.В. Маслова, Л.А Аляева, В.А. Аляев, судебный следователь А.Е Култашев, акцизный чиновник П.А. Виноградов… коренное население города давно привыкло относиться к подобным пришлым интеллигентным лицам с известным предубеждением, вообще как к лицам мало религиозным. И, представьте себе, как все были поражены появлением этой интеллигенции в качестве певчих на церковном клиросе! По мере того, как в городе разносилась весть об этом хоре, в церковь стекается все большее и большее число молящихся все идут, чтобы воочию убедиться в таком невиданном зрелище».
В 1796 г. построена прихожанами каменная Никитская церковь. Колокольня построена во второй половине XIX в. В 1941 г.
Покровский храм был закрыт и разорен, уничтожено венчавшее его пятиглавие. В перестроенных Покровской и Никитской церквях была размещена автостанция, храмы восстановлены в 1990-е гг. В 1988 г верующим был возвращен Никитский храм, в 1992 г. полностью восстановленный Покровский храм был освящен Преосвященным Евлогием епископом Владимирским и Суздальским. В 1991 г. были обретены мощи святого благоверного князя Святослава Всеволодовича, в настоящее время они покоятся в Покровском храме города Юрьев- Польского(на фотографии сень над ракой с мощами благоверного князя Святослава Всеволодовича).